BLASTN 2.2.3 [May-13-2002]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= BA0AB032B02SP1|AL429512
(890 letters)
Database: Klactis 3X assemblage 11/02
1807 sequences; 10,358,551 total letters
Searching....done
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Query: 685 ctttcggtaattttgcttctttgttttttactttaatttctttttcctcctttcctct 742
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Query: 4 acaccacatacctaatcaaatccgtacaccacatacctaatcaaatccgtacaccacata 63
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Sbjct: 396 ca 397
Score = 302 bits (152), Expect = 1e-81
Identities = 204/220 (92%), Gaps = 1/220 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 290 ctaatcaaatccgtacaccacatacctaatcaaa-tccgtacaccacatacctaatcaaa 348
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Sbjct: 25 ctaatcaaatccgtacaccacatacctaatcaaaatccgtacaccacatacctaatcaaa 84
Query: 349 tccgtacaccacatacctaatcaaatccgtacaccacatacctaatcaaatccgtacacc 408
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Sbjct: 85 tccgtacaccacatacctaatcaaatccgtacaccacatacctaatcaaatccgtacacc 144
Query: 409 acatacctaatcaaatccgttcaccacatacctaatcaaatccgtacaccacatacctaa 468
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Sbjct: 145 acatacctaatcaaatccgtacaccacagaccgaagcaaagccggacaccacagaccgaa 204
Query: 469 tcaaatccgtacaccacatacctaatcaaatccgtacacc 508
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Sbjct: 205 gcaaagccggacaccacagaccgaagcaaagccgtacacc 244
Database: Klactis 3X assemblage 11/02
Posted date: Nov 27, 2002 12:23 PM
Number of letters in database: 10,358,551
Number of sequences in database: 1807
Lambda K H
1.38 0.711 1.31
Gapped
Lambda K H
1.38 0.711 1.31
Matrix: blastn matrix:1 -3
Gap Penalties: Existence: 5, Extension: 2
Number of Hits to DB: 11,734
Number of Sequences: 1807
Number of extensions: 11734
Number of successful extensions: 1116
Number of sequences better than 1.0e-20: 10
length of query: 890
length of database: 10,358,551
effective HSP length: 16
effective length of query: 874
effective length of database: 10,329,639
effective search space: 9028104486
effective search space used: 9028104486
T: 0
A: 40
X1: 6 (11.9 bits)
X2: 15 (29.8 bits)
S1: 12 (24.3 bits)
S2: 50 (99.7 bits)